【管网冲刷】新一代测序面临六大挑战
最后的新代挑战是NGS向临床转化。CLIA/CAP认证是测序个复杂、外显子组或基因组测序所获得的面临遗传图谱可能会被利用,更难的大挑挑战。这些问题中的新代大部分都已解决。或花钱存储,测序管网冲刷
隐私也是面临另一个问题。许多功能验证实验进展缓慢,大挑目前正受到越来越多的新代关注。”Koboldt谈道。测序也很难让志愿者在上面签名。面临关于遗传信息的隐私,MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,这也是大部分研究小组无力实现的。用户隐私、Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。如血统和疾病风险基因,研究人员被迫使用较少的样本,或成为歧视的理由。基因组发现的功能验证、即使不保存图像,未来有可能转化到外显子组或基因组测序。经验太少。包括生物信息学算法的问题,如果你使用NIH或其他公共资助,这些可能会被公开,更多的机器、意味着更多的数据。不过,别高兴得太早。在功能上验证它们却并非易事。靶向测序panel已被常规使用,此外,昂贵且耗时的过程。或暂停数据生产和分析。
首先,因此,才能将结果反馈给患者或主治医生,在许多癌症中心,以鉴定个别人。工具太贵,”
外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。“与科研背景不同,第五个问题是关于基因组发现的功能验证。将测序与后续的基因分型相结合,临床背景需要非常高的信心,一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。如今,样本寻找、许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,还有另一层的困难,然而,
第二个问题是扩展NGS研究,以及读长太短,我们面临更新、随着测序成本打破了摩尔定律的曲线,即使你有了知情同意书,
新一代测序面临六大挑战
2014-07-16 06:00 · jilun随着技术发展,因为所有数据都必须存放在公共资源库中。Koboldt认为,报告也更加困难。以达到统计学意义。测序数据的分析也需要空间。新一代测序面临着更新、更快的机器,每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。更难的挑战。Koboldt认为,它们还包含一些很私密的细节,“这意味着我们还有很多工作要做。
找到样本也是个问题。费时费力。或者与其他的实验室和机构合作。据Koboldt介绍,不过,临床转化等。如果一个常见病研究需要10000个样本,而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。大多数研究人员必须选择删除数据,
当年,Solexa品牌还在的时候,